Exame (Nomenclatura Senne) Painel Filmarray (PCR), Liquor

Detecção rápida de meningite e encefalite causada por:
-Escherichia coli K1
-Haemophilus influenzae
-Listeria monocytogenes
-Neississeria meningitidis
-Streptococcus agalactiae
-Streptococcus pneumoniae
-Citomegalovirus (CMV)
-Enterovírus
-Herpes simplex virus 1 (HSV-1)
-Herpes simplex virus 2 (HSV-2)
-Herpes simplex virus 6 (HHV-6)
-Parechovírus humano
-Varicella zoster virus (VZV)
-Cryptococcus neoformans / gattii

BACTÉRIAS

1.Escherichia coli: são responsáveis por quase 80% de E coli isoladas do líquido cefalorraquidiano (LCR). Embora a maioria dos E. coli sejam organismos entéricos inofensivos que residem nos intestinos de humanos e animais, alguns causam doenças gastrintestinais e infecções extraintestinais (por exemplo, infecções do trato urinário, bacteremia e meningite). A E. coli associada à meningite contém fatores de virulência que contribuem para sua patogênese, permitindo que eles se espalhem pelo sangue, sequestrem as funções normais da célula hospedeira, infiltrem as células endoteliais e obtenham acesso aos tecidos do sistema nervoso central (SNC). O antígeno K1 é uma cápsula que protege as bactérias do sistema imunológico. Essas infecções são particularmente preocupantes para bebês prematuros/recém-nascidos e são responsáveis por quase 45% e 30% dos casos de meningite nessas faixas etárias, com uma taxa de mortalidade de 13% e 25%, respectivamente. As infecções em adultos são menos comuns e geralmente de natureza oportunista após a exposição de órgãos estéreis a conteúdo do trato gastrointestinal após trauma ou procedimentos cirúrgicos; a taxa de mortalidade para adultos é de 28% a 36%.
As cepas que possuem o antígeno capsular K1 (E.coli K1) serão detectadas. Todas as outras cepas e sorotipos de E coli não serão detectados.

2.Haemophilus influenzae: é um cocobacilo Gram-negativo que é isolado exclusivamente de humanos. As cepas de H influenzae são divididas em 2 grupos com base na presença ou ausência de uma cápsula polissacarídica. As cepas encapsuladas são divididas em 6 sorotipos (A até F). Antes da vacinação generalizada do tipo H. influenzae b (Hib) conjugadas, o Hib causaram mais de 80% das infecções por H. influenzae invasivos, predominantemente em crianças com menos de 5 anos de idade, com uma taxa de mortalidade de 3% a 6% e mais 20% a 30% desenvolvem sequelas permanentes que variam de perda auditiva leve a retardo mental. Em áreas com vacinação de rotina, a maioria das infecções por H. influenzae invasivos são causadas por estirpes não tipáveis e continuam a ser uma causa importante de meningite, em particular para as pessoas com predisposição, tais como otite ou sinusite, diabetes, deficiência imunológica, ou trauma craniano com extravasamento de líquor. A meningite por H influenzae ocorre a uma taxa estimada de 0,08 casos por 100.000 nos Estados Unidos e tem sido relatada como o agente etiológico de meningite bacteriana em 20% a 50% dos casos em todo o mundo nas últimas décadas.
3. Listeria monocytogenes: é um bacilo Gram-positivo que é onipresente no solo e na água e pode ser encontrado no trato gastrointestinal de até 5% de adultos humanos saudáveis. A listeriose é considerada uma das infecções alimentares bacterianas mais graves, devido à sua alta taxa de mortalidade, mesmo com o tratamento antibiótico precoce (11% -60%). A listeriose invasiva pode resultar em aborto, sepse, meningite e meningoencefalite. As populações com maior risco de desenvolver listeriose invasiva incluem os imunodeprimidos, as mulheres grávidas, os recém-nascidos e os idosos. A meningite por L monocytogenes é relatada como sendo aproximadamente 0,05 casos por 100.000 pessoas nos Estados Unidos por ano, e causa de 0,5% a 2,0% de casos de meningite bacteriana em países não-americanos.
4. Neisseria meningitidis: é um diplococo, aeróbio e Gram-negativo que é transmitido por contato com muco ou gotículas respiratórias, geralmente de portadores assintomáticos. Existem pelo menos 12 sorogrupos diferentes de N meningitidis, 6 dos quais estão associados a epidemias (grupos A, B, C, W135, X e Y). O sorogrupo refere-se aos tipos de antígenos capsulares. A doença meningocócica (meningite e meningococemia) é rara nos países desenvolvidos, mas pode ocorrer em surtos e ainda é um problema de saúde pública nos países em desenvolvimento. É mais comum em bebês, crianças e adultos jovens e aparece em locais com condições de vida lotadas (por exemplo, dormitórios universitários e quartéis militares). A incidência sazonal tem seu pico no final do inverno e início da primavera, com uma incidência anual de cerca de 0,2 casos por 100.000 nos Estados Unidos. A doença pode progredir extremamente rapidamente (<24 horas) com hipotensão, disfunção de múltiplos órgãos, choque, isquemia periférica e perda de membros, e tem uma taxa de mortalidade de aproximadamente 5% a 10%. Existem vacinas meningocócicas licenciadas que podem ser usadas em pessoas de todas as idades, dependendo da vacina. Apesar dos extensos esforços de vacinação em todo o mundo, vários sorogrupos de N meningitidis ainda causam surtos sazonais. Reduções extremas na meningite meningocócica do sorogrupo C foram observadas em países onde as vacinas que fornecem proteção para este sorogrupo foram introduzidas.
5. Streptococcus agalactiae (SAG): é uma importante causa de meningite em recém-nascidos, particularmente aqueles que são prematuros, e é freqüentemente coincidente com a sepse neonatal. O fator de risco mais importante para a doença neonatal é a colonização materna com SAG. Desde 1996, as diretrizes do CDC (atualizadas em 2010) pediram tratamento profilático com antibióticos várias horas antes do parto em partos em risco, resultando em taxas decrescentes de SG neonatal. Em pacientes adultos, o SAG está associado a idade avançada ou condições graves de saúde subjacentes. A incidência geral é estimada em 0,25 infecções por 100.000 e a doença neonatal por SAG variou de 0,2 a 2,4 por 1.000 nascimentos nas últimas décadas. As taxas de mortalidade variam de 10% para neonatos a 25% a 30% em adultos.
6. Streptococcus pneumoniae: Coloniza o trato respiratório superior e é o patógeno respiratório mais freqüentemente isolado na pneumonia adquirida na comunidade. É também uma das principais causas de meningite, particularmente em pacientes pediátricos e idosos, e especialmente naqueles com condições médicas subjacentes, com uma taxa de incidência de aproximadamente 0,8 infecções por 100.000 nos EUA. Causa de 20% a 30% de meningite bacteriana. casos em países fora dos EUA. A taxa de mortalidade também é alta: 8% a 15% para crianças e 20% a 37% para adultos. A mortalidade aproxima-se de 50% em países com poucos recursos, especialmente onde a co-infecção pelo HIV é um fator. As sequelas neurológicas (comprometimento cognitivo, surdez, epilepsia) são relatadas em até 40% dos sobreviventes. As vacinas ajudaram a reduzir o risco de doença invasiva e pneumonia pneumocócica em 50% a 80%.

VÍRUS

7. Citomegalovírus: O citomegalovírus humano (CMV) é um vírus de DNA de cadeia dupla da família Herpesviridae. Dados de soroprevalência mostram que a infecção é quase onipresente na população mundial, com taxas próximas a 100% nos países em desenvolvimento e de 36% a 90% nos EUA, dependendo da idade e raça / etnia. Embora a doença grave em pacientes imunocompetentes seja rara, o CMV é um patógeno oportunista em indivíduos imunocomprometidos ou imunossuprimidos, seja como infecção inicial ou como ativação de uma infecção latente. Em alguns pacientes (Ex: receptores de transplante), o CMV pode infectar o sistema nervoso central e causar meningoencefalite.
8. Enterovírus (EV) : são pequenos vírus de RNA que são membros da família Picornaviridae e estão associados a doenças humanas desde infecções assintomáticas ou leves até graves doenças do SNC que requerem hospitalização. As taxas de infecção são mais altas em crianças, com a maioria das infecções ocorrendo durante os meses de verão. Os sorotipos de EV mais comuns são os vírus coxsackie A9 e B1 e os ecovovírus 6, 9 e 18, que representam mais de 50% das detecções sorotipadas. As infecções são disseminadas por vias fecais-orais e respiratórias e podem se espalhar rapidamente em ambientes comunitários, particularmente em áreas com saneamento deficiente. O EV é uma das causas comumente identificadas de encefalite / meningite infecciosa, com taxas de prevalência relatadas entre 5,5% e 30%, dependendo da localização e da demografia do paciente.
9. Herpes simplex 1 e 2 (HSV-1 e HSV-2): são vírus de DNA da família Herpesviridae, responsáveis para a disseminação de ulcerações cutâneas. As infecções por HSV-1 geralmente ocorrem no início da infância e se manifestam principalmente como lesões orais, enquanto o HSV-2 está primariamente associado a lesões genitais e infecções relacionadas à atividade sexual. O HSV estabelece a residência nas células nervosas após a infecção inicial (que é assintomática na maioria dos casos). A ativação viral que resulta em lesões ou outros desfechos graves da doença (como infecção do SNC) pode ocorrer ao longo da vida e está associada a febre, lesão, exposição à radiação ultravioleta (luz solar), estresse emocional, irregularidades hormonais e alterações no estado imunológico. Em todo o mundo, estima-se que aproximadamente 90% das pessoas estejam infectadas pelo HSV-1; O HSV-2 é menos comum com 15% a 80% das pessoas infectadas. O HSV é uma das causas mais comuns de encefalite viral e é uma causa significativa de meningite. Em um grande estudo com mais de 1.600 amostras de LCR no Reino Unido, o HSV-1 foi encontrado em 25 (1,5%) pacientes (quase todos com encefalite) e o HSV-2 em 33 (1,9%) pacientes (quase todos dos quais tinha meningite). Essa prevalência geral de aproximadamente 3% no LCR é semelhante à observada em um estudo recente de pacientes com FCL no estado de Nova York. Este estudo também viu uma distribuição similar de HSV-1 e HSV-2 na encefalite versus meningite.
10. Herpesvírus humano 6 (HHV-6): foi descoberto em meados da década de 1980, quando o aumento de pacientes imunocomprometidos levou a um aumento na população suscetível a um desfecho grave da doença. Existem 2 espécies: HHV-6A e HHV-6B. Estudos mostraram que mais de 95% das pessoas com mais de 2 anos de idade são positivas para 1 ou ambas as variantes e a infecção estabelece latência devido à integração viral nas células do hospedeiro. Enquanto a infecção primária pelo HHV-6B causa roséola em lactentes, as manifestações clínicas da infecção primária pelo HHV-6A permanecem um tanto indefinidas; entretanto, alguns estudos sugeriram que a infecção por HHV-6A pode estar ligada a doença inflamatória ou neurológica, e que o HHV-6A pode ter um aumento no neurotropismo comparado ao HHV-6B. Esta hipótese é apoiada pela constatação de que o HHV-6 habita os tecidos do SNC, incluindo o cérebro, onde pode causar danos nos tecidos levando a encefalite ou meningite. Além disso, o HHV-6 foi identificado no LCR de 1,8% dos pacientes com encefalite ou meningite em um estudo recente. A doença do SNC associada ao HHV-6 é encontrada em crianças e adultos, sugerindo que a invasão do SNC durante a infecção primária é possível. Enquanto pacientes imunocompetentes podem apresentar infecção do SNC, é muito mais comum em indivíduos gravemente imunossuprimidos. No entanto, o HHV-6 é conhecido por reativar em pacientes assintomáticos e pode ser detectado por PCR em indivíduos saudáveis, sem sinais de infecção ativa pelo HHV-6. Estudos do HHV-6 em tecido cerebral normal também identificaram o DNA do HHV-6 via PCR em até 85% dos pacientes sem sinais de infecção ativa e o DNA do HHV-6 pode persistir no LCR após a infecção aguda. Em um estudo com 56 pacientes transplantados de células-tronco alogênicas, o DNA do HHV-6 foi detectado no LCR de 14 (27%) pacientes sem sintomas do sistema nervoso central (SNC). Dada a prevalência de infecção latente e o potencial de reativação assintomática, os resultados positivos para o HHV-6 devem ser interpretados com cuidado em associação com sintomas clínicos e exames laboratoriais complementares.
11. Parechovírus humanos (HPeV): compreendem um gênero da família Picornaviridae. HPeV foram originalmente classificados como enterovírus após a sua descoberta na década de 1950 e pelo menos uma dúzia de sorotipos foram identificados. A soroprevalência para HPeV-1 se aproxima de 100% nas populações adultas, com a maioria das infecções ocorrendo durante a primeira infância. Tal como acontece com o EV, as infecções são transmitidas por via fecal-oral e respiratória; com os sintomas mais comuns sendo doença respiratória ou gastrointestinal leve. A doença do SNC do HPeV-1 é rara, mas o HPeV-3 está associado a desfechos graves da doença, como sepse, encefalite, meningite e hepatite em crianças menores de 3 meses de idade. Estudos recentes de LCR de lactentes com suspeita de doença ou sepse no SNC demonstraram HPeV com uma prevalência de 3% a 17%, quase todos os quais eram HPeV-3. Estudos de ressonância magnética de crianças que sobrevivem à doença do HPeV SNC mostram danos à substância branca do cérebro e deficiências de desenvolvimento mais tarde na vida.
12. Varicela zoster (VZV) é um vírus de DNA de cadeia dupla da família Herpesviridae que geralmente causa infecções na infância (catapora) e estabelece presença latente em células que podem se reativar mais tarde na vida. O VZV é primariamente disseminado através de secreções respiratórias ou contato direto com lesões de um indivíduo infectado, e a infecção de novos hospedeiros começa dentro das células epiteliais do trato respiratório. Após a infecção primária (febre e mal-estar acompanhados de erupção maculopapular), o VZV se estabelece nos gânglios sensitivos do sistema nervoso, onde permanece latente. Nos Estados Unidos, quase 90% da população havia sido infectada com VZV antes do advento das vacinas. Taxas similares foram relatadas em países europeus. Dos infectados, entre 10% e 30% desenvolvem zóster (uma erupção cutânea dolorosa ao longo dos gânglios dorsais), principalmente mais tarde na vida. Estima-se que a incidência global mediana de zóster seja de 4,0 a 4,5 por 1.000 pessoas-ano, o que destaca a frequência de reativação do VZV em todo o mundo. Estudos demonstraram que o VZV é transitoriamente detectável por PCR no sangue de indivíduos idosos assintomáticos (imunocompetentes e imunocomprometidos), sugerindo que a reativação ocorre ao longo da vida, mas geralmente é administrada pelo sistema imunológico. Encefalite e meningite são complicações das infecções por varicela e zoster. Em um estudo, o VZV foi o terceiro vírus mais detectado entre pacientes com sinais e sintomas de encefalite ou meningite, com uma prevalência relatada de 1,9% na população estudada. Existem vacinas VZV vivas e atenuadas licenciadas para vacinação de crianças contra varicela e adultos contra zóster.

FUNGOS

13. Cryptococcus neoformans e Cryptococcus gattii: são fungos patogênicos que são adquiridos por inalação e podem se disseminar para outros sistemas orgânicos (particularmente o cérebro e as meninges). C neoformans é considerado um patógeno oportunista de indivíduos imunocomprometidos. É a doença que define a AIDS em até 50% dos pacientes com AIDS. As infecções por C gattii são relativamente raras, mas parecem estar aumentando. Embora normalmente associado a climas tropicais e subtropicais, desde a década de 1990, foram notificadas infecções por C gattii na Colúmbia Britânica, no Canadá, na região Noroeste do Pacífico dos EUA, no nordeste dos EUA e na Europa. Além daqueles com função imunológica reduzida, C gattii também pode causar doenças no imunocompetente, particularmente em pessoas com condições de saúde subjacentes. A mortalidade por meningite criptocócica é alta, variando de 10% a quase 50% em pacientes imunocomprometidos.

• Coleta de liquor deve ser realizada por médico treinado.
• Sempre observar se há contra-indicações para a coleta do LCR: Alteração no coagulograma, uso de medicações anticoagulantes, hipertensão intra-craniana, infeções no local do procedimento, agitação psicomotora do paciente.
• Amostra deve ser armazenada de acordo com acondicionamento para transporte.

1. Domingues, R; Vega, M; Brunale, F; Senne, C : FilmArray Meningitis/Encephalitis (ME) panel in the diagnosis of bacterial meningitis BJID - 2019.

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4. https://www.mayocliniclabs.com